Район расположен в южной части Краснодарского края и граничит с Туапсинским районом на западе, Белореченским районом на севере, республикой Адыгея на востоке, городскими округом города Горячий Ключ на северо-западе и городским округом города Сочи на юге.
Площадь района составляет — 2443,2 км². Территория района входит в предгорную зону северного склона и зону средневысотных гор западной оконечности Большого Кавказа. Абсолютные отметки в зоне низкогорий 100—500 м. Эта территория представляет собой невысокие платообразные увалы с общим уклоном к северу и холмистые возвышенности сильно изрезанные балками и оврагами. На юге и юго-востоке Апшеронского района сравнительно небольшую часть занимают высокие горы (1000—1500 м) с резко выраженными формами рельефа.